对于强直性脊柱炎的诊断，一般并不困难，但在临床上常常碰到不典型的病例，若医师警惕性不高，则极易发生漏诊；另外，某些引起腰背痛的疾病，如脊柱、骨盆原发或转移的肿瘤，腰椎间盘突出等，也常易被误诊为强直性脊柱炎。                  

强直性脊柱炎早期仅表现为腰骶、下背部疼痛及晨僵，常不引起注意而被误诊为其他疾病，有半数病例延至发病3年以后才被确诊为本病。

 在临床上，强直性脊柱炎需同类风湿关节炎、骨关节炎、椎间盘突出症、急慢性腰肌劳损等鉴别。