扫描序列
是指射频脉冲、梯度场和信号采集时刻等相关参数的设置及其在时序上的排列。MR成像主要依赖于四个因素：即质子密度、T1、T2、流空效应，应用不同的磁共振扫描序列可以得到反映这些因素不同侧重点的图像。目前最基本、最常用的脉冲序列为SE序列，其它还包括GRE序列、IR序列等。
1）自旋回波(spin echo，SE)
首先发射一个90。的射频脉冲后，间隔数至数十毫秒，发射1个180。的射频脉冲，再过数十毫秒后，测量回波信号。是MR成像的经典序列，特点是在90。脉冲激发后，利用180。复相脉冲，以剔除主磁场不均匀造成的横向磁化矢量衰减。SE序列的加权成像有三种：
A、质子密度N(H)加权像：参数选择：长TR(1500ms～2500ms)短TE(15ms～30ms)。采集的回波信号幅度与主要质子密度有关，因而这种图像称为质子密度加权像。
B、T2加权像：参数选择：长TR(1500ms～2500ms)长TE(90ms～120ms)。采集的回波信号幅度主要反映各组织的T2弛豫差别，因而这种图像称为T2加权像。
C、T1加权像：参数选择：短TR(500ms左右)短TE(15ms～30ms)。采集的回波信号幅度主要反映各组织的T1驰豫差别，因而这种图像称为T1加权像。
特点：1、图像信噪比高，组织对比良好；2、序列结构简单，信号变化容易解释；3、对磁场不均匀敏感性低，没有明显磁化率伪影；4、采集时间长，容易产生运动伪影，难以进行动态增强。
2）快速自旋回波序列
在一次90。RF激发后利用多个(2个以上)180。复相脉冲产生多个自旋回波，每个回波的相位编码不同，填充K空间的不同位置。不同厂家的MRI仪上有不同的名称，安科公司和GE公司称之为FSE(fast spin echo，FSE)，西门子公司和飞利浦公司称之为TSE(turbo spin echo)。FSE以前也称弛豫增强快速采集(rapid acquisition with relaxation enhancement，RARE)。
特点：1、快速成像，FSE序列的采集时间随ETL的延长而成比例缩短；2、回波链中每个回波信号TE不同，FSE序列的T2对比较SE序列下降，ETL越长，对图像对比的影响越大；3、回波链中每个回波信号强度不同，在傅里叶转换中发生对位错误，导致图像模糊；4、脂肪组织信号强度增高；5、对磁场不均匀性不敏感；6、能量沉积增加。ETL越长，ES越小，越明显。
3）反转恢复序列
具有180。反转预脉冲的序列统称反转恢复类序列。短反转时间的反转恢复(short TI inversion recovery，STIR)主要用于T2WI的脂肪抑制；液体抑制反转恢复(fluid attenuated inversion recovery，FLAIR)可以有效的抑制自由水的信号。
特点：1、增加T1对比度；2、选择性抑制一定T1值的组织信号；3、信噪比相对SE序列降低；4、扫描时间长。
4）梯度回波序列(gradient echo pulse sequence，GRE)
是利用梯度回波的MR成像，梯度回波与自旋回波类似，自旋回波的产生是利用180。复相脉冲，而梯度回波的产生是在一次RF激发后，利用读出梯度场方向正反向切换产生一个梯度回波。
特点：1、小角度激发，加快成像速度；2、T2*弛豫，不能剔除主磁场不均匀因素；3、图像信噪比较低；4、对磁场不均匀性敏感；5、血流常呈高信号。
5）平面回波成像(echo planar imaging，EPI)
是目前MR成像最快的序列，MR信号也属梯度回波。与一般梯度回波不同的是在一次RF激发后，利用读出梯度场的连续正反向切换，每次切换产生一个梯度回波，因而有回波链的存在，与FSE序列类似。
特点：1、成像速度快，可达亚秒级；2、伪影多，信噪比差；3、对磁场不均匀性敏感；4、梯度变换速率为潜在危险因素。